Так DPI или герцовку менял? Это таки разные вещи.
Менял наверняка через приложение для мышки. Тут есть два варианта:
1. Либо сначала закрой все окна Атланты, измени нужные параметры, закрой приложение мышки и снова заходи на Атланту
2. Либо если изменения параметров не работают без приложения для мышки, смирись и играй с настройками по умолчанию.
Оффтоп: какая матрица на мониторе?